在土家族医学临床运用上非常灵活。考虑到病情的复杂性，往往不是单一的方法所能适应，所以，常常是几种方法结合运用，共同发挥作用，达到并提高治疗效果。
土家医的治疗方法丰富多彩，归纳起来可分成两大类——药物治疗和非药物治疗，或者内治法和外治法。土家医治疗疾病，主要用汗法、泻法、赶法、止法、补法、温法、清法等7种治疗方法，现将其具体内容介绍如下：
汗法：是开通汗窍、驱逐瘟气的一种治疗方法。
泻法：该法是驱逐体内结滞、通泄二便的一种治法。
赶法：是祛除体内湿气、风气、气滞、血瘀的一种治疗方法。
止法：是通过药物的作用，达到制止出血、遗尿、遗精、崩带、汗出不止的一种治疗方法。
补法：是通过药物来滋补人体气血精，或补益三元脏器虚损的一种治法。它主要用于一切虚症。
温法：是通过药物的作用达到温暖三元脏器的一种治疗方法。主要用于形寒肢冷，胸腹冷痛，吐泻清冷的内寒证。
清法：是通过药物作用达到祛除三元脏器火毒的一种治疗方法。