土家药匠在与疾病长期的斗争中，在积累大量的经验的同时，对一些常见病症或疑难杂症等都有不同的治疗方法。土家药匠在治疗的过程中遇到的疾病，会为其起一个生动形象且易于掌握的病名，便于更好的传承去，这些病名有一定的规律性可循，具有相当浓厚的民族特色。
(一)根据患病部位命名
如疱疮长在耳后称为耳背；耳下的称为耳寸；长在背后的为背花、背痈；长在虎口处的称为手叉；长在肩上称为担肩。流痰长在大腿下面的为吊肚；长在肚子上的为肚流；附骨而长的叫巴骨流痰。痈在奶上的叫奶痈，疔疮长在鼻子上的叫鼻疗；长在嘴巴上的叫唇疔；长在关节处的叫节骨疔。疮长在阴门的叫衙门疮；长在胸前的叫对口疮。脑売痛，病在头，气痛病在肚，心气痛病在心；腰痛病在腰，脚麻叫麻脚症等。
(二)以临床表现命名
某些疾病是根据病人的临床表现而命名的。如突然昏倒，不省人事叫扑地惊。解小便时痛，尿见红色的叫尿积。体虚而解小便色白的为虚积下白。妇女不在坐小月时来血水叫摆红。衙门流白色腌腊物叫摆白。妇女月事血来如潮的叫血崩山。长期咯或时而痰中荷血的叫肺痨、七窍出血叫红痧症。半边肢体瘫痪的叫半边风。肚子肿胀如鼓的叫水鼓症，又叫撮箕扑肚症。阴囊肿大的叫气囊脬。睾丸肿大的叫判罐。
(三)以动物形象命名
土家族世世代代居住山这里崇山峻岭，森林密布，动物成群，飞禽走兽遍地皆是。人们常上山打猎，对各种动物的生活一性及形态比较了解，所以土家族药匠将一些疾病与动物联系起来动物的形象来命名。如惊症类，绝大部分是以动物来命名的。如惊风时在地上打滚，手足动的叫泥鳅惊；四肢在地上爬的叫螃蟹惊，双手伸展扇动的叫飞蛾扑心惊；口张开像乌鸦叫的叫乌鸦惊；手举起、脚向上抬如上马之势的叫上马惊。痧症也多以动物形象命名。如狐狸痧、兔子痧、母猪痧、蚊子痧、青蛙痧等等。某些风症，如突然昏倒，口吐白沫，嘴像猪叫的为猪婆风，像羊叫的是羊癫风等。若患者的头左右看，口中像斑鸠叫为斑奶症。还有鸭子症、鹊雀症、猪儿症等。在临床上以动物形象命名的病名最多。
(四)以病因命名
有一部分疾病，是按致病因素来命名的。如因打压伤的叫打伤、压劳。房事过度的叫色劳。产后未满月而同房的叫月家劳。由喝水或游泳时呛着水的叫水呛。由寒湿做侵人关节的叫冷骨风。因痰湿而致身体某部位肿胀痛的叫流痰。由风气而致病的，就有脐风、风湿、中风、风螃、冷节风、漆风等几十种。因火而致病的，有火眼、火牙痛、火流、火巴疮、火疔等，因霉气而致病的有霉症类，如阴霉、湿霉。因气而致病的有气肿、气胀、隔气、肚胀气等。
(五)以发病季节命名
有的疾病命名是按发病季节来取名的，如桃花症，在春季桃树开花时发病；芒种症，是在夏季芒种时发病；秋燥症，是在秋季发病：伤寒症，多在冬季复发。
(六)按疾病的性质命名
土家医对于某些疾病是按病的性质命名。如肚子胀而硬的叫铁板症；小儿于瘦不食的叫走胎；肚子痛如刀绞的叫绞肠痧症；上吐下泻的叫霍乱症；大便有膏冻带血的叫厨痢症；口突然不能讲话，但能张开的叫哑巴症等。