苗医在理论上有“两病两纲”之说，即将一切疾病归纳为冷病、热病两大类，“两纲”即“冷病热治、热病冷治”两大治则。现将诊断方法简述如下。苗医通过望、听、嗅、问、摸、弹等方法搜集疾病表现的各种症状和体征，结合天时地域及其他条件进行综合分析，辨清冷、热二病，分别所属病证，为治疗原则和具体治法提供重要依据。
（一）望诊主要望形态、神志、面色、眼球、四毛（头发、眉毛、睫毛、毫毛）、口舌、耳壳、鼻、指纹、指甲、手掌、二便、病灶等，尤对望四毛、口舌、鼻、指纹、指甲、掌纹方面独具特色。
1、望四毛：病人头发光泽，无明显改变，主病情轻而易治，病中头发失泽，枯槁而乱，是重病久病之象，治疗较难。小儿头发干枯无泽，卷曲，眉乱而坚，为“牛胎”病，头发枯黄而乱，多为“猪胎”病。眉毛乱而失泽，欲皱眉而眉不举，称“眉下坎”是重症病象，眉光秃而面腻为“麻风证”，眉如新月多聪贤，眉乱细软失泽多体弱。睫毛难举，或举而不灵为重病，举而灵者为轻病，双睫毛举而不闭为“突眼病”，单睫举而不全闭多见于“中风证”。
望毫毛主要是以两鬓角下、两肘、两膝以下部位，观其色泽、顺乱情况，毫毛竖而卷曲为慢性病，竖乱、枯槁、失泽为重病。望耳壳耳壳枯黄、薄而透亮为冷病、久病，耳壳紫红为热病，小儿耳壳萎黄、薄而透亮、指甲色紫、喜咬于指为“花胎”病。
2、望口舌：通过对口腔粘膜、口唇色泽、形态、舌质、舌色、舌态、舌苔等变化来诊断疾病，口腔粘膜色红为热病，色淡为冷病，色紫暗而黑为重症，粘膜呈沟路形糜烂、分泌脓液、味臭为“白口腻”，口内生疮色白如菌朵样突起叫“白口菌”。唇色深红为热病，苍白失泽为冷病，孕妇唇苍白谨防难产，唇青时时吐涎，母子难全。久病突见唇若涂朱或人中色白，或上唇缩短，皆为病情危重之象。舌红为轻热，绛红为重热，紫而干为极热，舌淡白或青蓝或紫润者皆为冷病，舌边缘长出两条肉筋抱住大舌（叫双龙抱柱），或舌生恶肉头大蒂小、溃烂而臭，或舌下长出一条似舌非舌的半月状肿物，将大舌往上顶者均为热病，舌胖大淡润，边有齿印者为冷病。
3、望鼻：鼻腔淡白无泽、鼻尖色白，或青、黄失泽为冷病；若腔内潮红或赤肿，或鼻尖色红为热病。男子鼻翼色黑下连人中，多有阴茎、睾丸疾患；女子鼻翼色黑多有经带疾患。鼻内生瘤称为“鼻舌”。初病鼻煽为热病，久病鼻煽为冷病。病中鼻尖歪斜主病危。
2、望指纹；主要用于小儿，观察食指外侧的脉络纹，脉络粗壮一端名“蛇头”，细小一端名“蛇尾”，粗壮端由指根往指尖爬行名“去蛇”，主伤于湿气为冷病；由指尖往指根爬行名“来蛇”，主伤于风雨为热病，脉络连接间断，形如滴水状，时隐时现，名“流珠”，主伤食；连接间断，形如丸珠者名“圆珠”，主热病。
5、望指甲：指甲色苍或青，按之回血缓慢，或久病甲青者为冷病；指甲红紫、按之回血快者为热病；指甲扁平或凹陷，周围隆起，多为肝病；若数根或全部指甲中心呈一横条鼓出多为心病；若呈竖条破裂多见于“米黄证”或老年人（老年性甲退化）。
6、望手掌：大、小鱼际红赤为热病，苍白为冷病，黄而枯瘦为慢性病，枯燥色黑为肾病，长期色红，刮之退色，即刻复红为肝病，大鱼际的弧形褶皱纹下端近掌根处的分叉叫“撑叉”，其位置低则孕育功能强，位置高则体衰而孕育功能弱，位置靠近掌心处称不育线，多为孕育能力差。
（二）听诊主要听病人说话、呻吟、咳嗽、呼吸、打呃、肠鸣、排屁等声音变化诊断疾病。若声音高亢有力，或重浊气粗者为热病；声低沉长无力者多为冷病。初病语音声嘶为热病，久病声嘶为冷病。因恼怒而咳声连作，气不得续，甚或咳血为“气咳”，连续大声呻吟，双手抱腹、翻来滚去，表情痛苦，面色苍白或青，伴大汗淋漓者多为“鲤鱼摆滩经”。
（三）嗅诊是医生嗅病人的体气、口气及排泄物、分泌物的‘气味变化以诊断疾病。如大便焦臭、小便浑浊而臭，或排屁臭如腐蛋，或汗后有酸臭味均为热病。若大便腥臭、小便清长无臭，或久病屁多不臭均为冷病。
（四）问诊主要问发病时辰、冷热、疼痛、汗出、饮食、睡眠、二便、经带等内容。如初病发冷热，或先热后冷、先冷后热、冷热相兼皆为热病，长期发冷怕冷、或低热者，均为冷病；急性头痛为热病，久病头痛为冷病；急性腹痛、饱痛、绞痛、刺痛、白天发作、喜冷拒按者均为热病，腹部久痛、饿痛、隐痛、冷痛、夜晚发作、喜温喜按者为冷病；腰部急痛、胀痛、热痛为热病，久痛、冷痛、木痛、酸痛、隐痛为冷病。初病有汗，汗热身热者为热病，病中无汗，或久病汗出，或夜间汗出、汗冷身冷者为冷病，病重而大汗淋漓不止者为危候。病中喜冷饮、多食易饥者为热病、喜热饮或口淡食少为冷病，喜食泥土、生米等异物者多为“蛊疾”，喜吃自己的衣襟、布扣、谷米者为“米黄证”，若久病重病不进饮食，突然狂食暴饮不知饱食足者为病危，预后不良。
（五）摸诊主要指摸脉及病人体表的有关部位。苗医将脉象称为“大脉”（马之意），以喻脉搏跳动象马奔跑一样有节律，脉象有病脉、喜脉、寿脉之分，脉位有头部脉、寸口脉、腕部、五指、内外踝、内外膝眼下、足背、左乳下共16处。
1、头部脉称“大脉杯”，有双耳门前脉、耳后高骨下脉、双下颌下脉三处，此三处脉快而有力为热病，有发热头痛等症状，慢而无力为冷病。
2、上肢脉叫“大脉兜”，又称“上马脉”。包括肘脉、腕后脉、五指脉。肘脉位于肘部外侧，此处脉律紊乱多主消化道疾病，脉搏消失主病情危重。腕后脉分关脉和禄脉，关脉在掌后横纹由桡侧端起至尺侧端止，依次分为外关、中关、内关。禄脉在掌后桡骨小头内侧缘，从远心端起依次为上、中、下三部，禄脉又称总脉，是诊断疾病的主脉，但对某些疾病则要与其他脉位合参，如妇科的“月家乐证”既切禄脉又需与七点零二脉合参，重危病人既切禄脉又切下马脉的内膝眼下脉，如内膝眼下脉消失、禄脉微弱，病人在9日内医治得当尚有生机，否则预后不良；内膝眼下脉消失而禄脉正常，病虽重预后良好。禄脉快而有力为热病，慢而无力为冷病，极弱或难摸到是危候。通过禄脉可测妇女“空喜”、“实喜”，停经妇女双手禄脉圆滑应指多有妊为实喜，左手中部比右手下部搏动有力，妊娠多成功，右手下部比左手中部有力，虽妊娠但易流产。
禄脉有规律地跳三次停一次为三点零脉，跳四次停一次为四点零脉，以此类推有五点零脉、六点零脉，七次停搏一次，而虎口脉不停为七点零二脉，主妇女月家病。五指脉是患者各指第一、二节的两侧脉位，快而有力为热病，慢而弱为冷病，拇指脉快而有力主头痛、头昏，为惊骇所致。食指脉快而有力主冷热间发、恶心呕吐等，为外感所致。中指脉快而乱主心痛、胃痛。无名指脉急而乱，病情朝轻暮重。小指脉急强，病情日轻夜重，主下身疾患，如带下证、月家证，及男子阴囊、附睾等部疾病。胸部脉又称“大脉拦”，在左乳附近，分天脉、地脉、命脉。天脉在左乳上方，地脉在左乳中右下方，命脉在左乳左下方，此三部脉太弱，主多种“翻”病，过强多为心脏疾患。
3、下肢脉又称“大脉闹”，分内踝、外踝、足背三处。内踝脉在内踝上三寸至内膝下三寸处，此脉极弱或停搏多有下肢疾病或重危病。外踝脉在外踝上三寸及外膝下三寸处，正常人此脉较弱，若脉洪大主下肢疾病，如发于下肢的丹毒、疔、癜、癀等。足背脉在足背第一、二趾间后一横指处，此脉消失为重病或足疾。摸诊中对病人有关部位的触摸，以了解局部的温度、痛觉、色块的形状、大小、软硬、波动感等判断疾病。以摸前额对5岁以下小儿疾病诊断的功夫尤精，部位是由两眉中点起至前发际连线，分上、中、下三部，医生以食指、中指、无名指指腹分别摸病儿的上中下三部，三部皆灼手者为热病，可伴有鼻塞、气粗、咳嗽、发热等；三部发凉为冷病，可伴有发冷、呕吐、腹泻等；上、中两部灼手者为受惊骇所致；下部灼手甚于上、中二部，多为饮食积滞。
（六）弹诊 医者用五指提弹患者腋前、肩背、脊旁、肘窝、胭窝等处大筋或皮肤，若紧束不知疼痛，或随着提弹有色块隆起，或提弹处皮肤迅速出现乌黑色瘀点或瘀斑，并伴有剧烈头痛或胸腹痛，面苍唇白，指尖逆冷，恶心欲呕或吐泻等，多为“翻”病。