位于三亚市以西40公里的南山南麓，占地400亩。南山高500多米，山上终年云雾缭绕。南山寺的地理位置非常好，左右有山丘环抱，面向南海万顷碧波。
1200年前，鉴真大师偕日本留学僧荣睿、普照及鉴真徒弟等15人第五次东渡日本，遭遇台风后船漂到南山湾，从宁远河口登岸，并在崖城驻留一年多，在此期间修建佛殿，讲经渡人。后来鉴真大师第六次东渡日本获得成功，因此称颂南山为吉祥之地。