柯尔克孜语属阿勒泰语系突厥语族，有皆盖、特斯开两种方言。词汇的多源性是柯尔克孜语的一个特点。皆盖方言是柯尔克孜族现代书面标准语和文学语言的基础。皆盖方言因受哈萨克语影响，畜牧业词汇较丰富，有较多的哈萨克语借词及柯尔克孜语与哈萨克语结合而成的词汇和土语。特斯开方言则因受维吾尔语影响，农业词汇较丰富，有较多的维吾尔语借词及柯尔克孜语与维吾尔语结合而成的词汇和土语。但这两种方言只是在某些语音、词汇和土语上有所差别。
居住在克孜勒苏柯尔克孜自治州的柯尔克孜族大都使用本民族语言。居住在阿克陶县与维吾尔族杂居的柯尔克孜居民，大部分通用或兼用维吾尔语。居住在北疆伊犁地区特克斯县一带与哈萨克族杂居的柯尔克孜居民则大部分通用或兼用哈萨克语。塔城地区额敏县与哈萨克族、蒙古族杂居的柯尔克孜居民，大部分通用或兼用哈萨克语、蒙古语。黑龙江省富裕县的柯尔克孜族居民除保留了古代柯尔克孜语的许多特点外，由于与蒙古族、汉族长期杂居，因此也通用或兼用蒙古语、汉语。