独龙族的宗教信仰，还处于万物皆有灵的阶段，认为风、雨、雷、电、高山、大水、巨石、 怪树都有鬼。鬼的种类很多，南、北部地区各说不一。据说有“丘”（山鬼、岩鬼）、“益休”（路鬼）、“司多”（水鬼）、“别卡”（夜鬼）、“孟”（雷鬼），“沙沙”（江鬼）、“乃木”（野鬼）、“明戛沙卡”（天鬼）等十多种，除了这些属于自然现象的鬼外，他们也相信人死后有灵魂，有“息托”（变人的鬼，人类的祖先）及“排勒”（家鬼、祖先的鬼）两种。触犯了鬼，它就会降祸于人，发生灾荒疾病，如头痛、腹泻认为是被山鬼咬了，得了半身不遂的风湿病，就认为是野鬼缠住了，要请巫师杀牲祭鬼来调解。
巫师有两种：一称为“隆木沙”（类似傈僳族的“尼扒”），专门卜卦看鬼；另一种称为“班瓦当”（类似傈僳族的“尼古扒”），专门杀牲驱鬼。祭鬼时先由“隆木沙”用几根茅草卜卦 ，看病人是被哪种鬼给缠住了，要杀鸡或杀猪来祭它。他一手端着一杯酒，一手摇铃，为病人祈祷。然后请“班瓦当”来杀牲驱鬼。驱鬼时巫师头上系着虎牙及兽皮，挥舞长刀，呼啸跳跃，用粗暴严厉的神态来驱鬼。
巫师在社会上有很高的地位，尤其是大“隆木沙”受人尊重，他们除了在祭鬼时可得一腿肉以外，没有特殊的权利。巫师的产生不是继承，也没有一定的师傅，而是一些能说会道的人，在“隆木沙”祭鬼时偷偷学来的。自基督教传入以后，巫师的地位大不如从前了。
每年的秋收以前，要举行一次全村性的祭祀活动，大家出酒出粮食，杀牲（猪或者牛）祭天，庆祝丰收。另一种是有钱的人举行剽牛集会，一次最多剽三头牛，邻近的村寨及所有的亲戚朋友都来参加。祭奠由“隆木沙”主持，祭毕大家歌舞狂欢，青年男女借此机会跳舞欢乐，十分地热闹。牛的内脏当天全部煮吃，牛肉每人平均分得一份（南部地区当天全部吃完），主人也同样分得一份，剩下的骨头归主人，装在竹筒里，腐烂发臭后，每天吃饭时拿出来在汤里涮一下，然后又装在竹筒里。
每杀一头牛，牛头都挂在主人的墙上，引以为荣，也是富有的标志，最多的一家有十多个牛头。杀牛祭鬼对生产的破坏是很大的，是阻碍社会发展的原因之一。
独龙人绝大多数是实行土葬，也有少数因为患特殊疾病死亡而行火葬或者水葬。按独龙人的禁忌，尸体不能直接从大门抬出，必须从住房的后壁或地板处另开一道便门送出，认为这样做才能避免继续死人。出殡时，由一老人在前面挥刀驱鬼，在葬地划定坟圈，尸首侧卧，面向东方，埋后不垒坟。一家有丧事，村人及远近亲戚都要送粮食、鸡、酒等物，表示对死者的哀悼。埋葬的当天，全村停止生产活动，否则认为庄稼不生长或五谷也会被鬼给吃掉。
棺材临时用木板合成，死后第二天就埋在住宅附近，坟前竖一根木杆，将死者生前用具及亲友送来的鸡蛋挂在上面。
人死后数月，家属准备好酒肉后，要在家里举行祭奠仪式，亲友们也要送酒送肉来帮忙。祭典由“隆木沙”主持，嘱咐死者：保佑全家清吉平安，不生疾病，粮食丰收……。然后将祭品装在竹箩里，挂在坟前木杆上。以后不再祭扫，没有崇拜祖先的习惯观念，很多人都不知道祖辈三代的名字。