维吾尔族有许多禁忌沿袭下来。
在饮食方面，他们不吃未经念经宰杀的牲畜俐，不吃自死的牲畜，不吃未放血的牲畜：另外不吃猪、狗、驴、骡等家畜和禽类，在南疆的部分维吾尔族还禁食马肉。同时、对任何吃的东西不允许用脚踩，见到馕，饼干等食物掉在地上，要拣起来放在不易被踩到的地方；洗碗和涮锅的水不能倒在人们走路的地方，而要倒在墙旮旯或不易被人踩到的地方。
院落的大门禁朝西开，因为伊斯兰教的圣地在西边。但因地形所限，在无可奈何的情况下，也可例外。
在睡觉的时候，禁忌头胡东脚朝西。在屋内对坐的姿势也有要求，一般要求跪坐炕上或地毯上、禁忌双脚仲直、脚底朝人接受礼物或接茶碗时，要双手接、单手接被认为是不礼貌的行为。吃饭时不能随便拨弄盘中的食物，挑来拣去；不能随便到锅灶前面、不要剩食在碗中，如果不慎将饭屑或馕渣弄到地上、要拣起来放在近前的餐布上，不要将抓起的饭粒再放在共用的饭盘之中；吃饭或交谈时，禁止吐痰、擤鼻涕、打哈欠、放屁等；在麻扎（墓地）和清真寺内，以及劳呗、水源和伙房等地，禁忌大小便、随地吐痰和携带脏的东西；晚辈不得在长辈面前吸烟、喝酒，口吐粗鲁、龌龊的语言，见了长辈要起立、让座，并施礼问候。