两宋时期，畲族的活动地域基本上仍在原有的聚居区内。《漳州谕畲》所记载的畲事是对宋代闽南畲族地区政治，经济较为典型的描述。宋末元初，战乱频仍，畲族迁徙范围扩大，移民的路线错综复杂。这个时期的移民相当部分是军事性质的移民，最有代表性的是陈吊眼，许夫人，钟明亮等多支抗元畲军于漳州，潮州，泉州，汀州，赣州等处的转战屯守移民。